モール型と自社ECサイトではどちらが良いのかケースバイケースですが、比較をしてみるとすでにブランド力があるのであれば自社ECで、そうでなければモール型が良いような気がします。
ブランド力があり集客に困らないのであれば余計な経費をかけるのはもったいないので、自社ECサイトが有利です。
対してあまり名前が知られていないようであれば、モール型ECの知名度を利用して集客しやすくなる利点は大きいものがありますから、モール型ECサイトの方が強いのではないでしょうか。
どちらも良い点も悪い点もありますから、自身が予定しているECサイトの規模やブランド力を考慮しながら、利点の大きいと思える方を選択するのがおすすめです。